Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD27P26842 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD27P26842 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD27P26842 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms