Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms