Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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HOXA5P20719 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA5P20719 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA5P20719 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA5P20719 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA5P20719 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA5P20719 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA5P20719 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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