Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT10P13645 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms