Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT3P12035 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms