Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.7 ms