Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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