Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms