Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECSITQ9BQ95 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECSITQ9BQ95 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms