Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms