Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms