Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEIL2Q969S2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms