Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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