Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms