Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms