Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms