Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PKP1Q13835 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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