Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms