Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms