Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms