Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms