Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms