Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ME1P48163 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms