Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms