Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms