Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms