Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PVALBP20472 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms