Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FLT1P17948 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FLT1P17948 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FLT1P17948 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FLT1P17948 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FLT1P17948 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms