Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms