Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms