Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms