Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms