Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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