Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms