Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms