Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms