Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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