Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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