Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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