Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
STX4Q12846 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
STX4Q12846 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
STX4Q12846 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
STX4Q12846 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
STX4Q12846 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
STX4Q12846 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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