Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms