Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAP2Q03519 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms