Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms