Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBBP68871 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms