Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NME5P56597 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NME5P56597 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME5P56597 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME5P56597 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms