Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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