Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP2P42575 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms