Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMPOP42166 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms