Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms