Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED4Q9NPJ6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED4Q9NPJ6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED4Q9NPJ6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED4Q9NPJ6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED4Q9NPJ6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED4Q9NPJ6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms